Come per qualsiasi innovazione anche per i biocombustibili vantaggi e svantaggi sono da valutare con attenzione. Allo stato attuale delle cose, è richiesta maggiore ricerca finalizzata all’ottimizzazione della produzione dei nuovi combustibili. Tuttavia, i cavalli favoriti, per il momento, rimangono le energie rinnovabili convenzionali: eolico, solare e fotovoltaico.